第11話 チャック VS 新幹線
あらすじ・感想
クインはチャックにサラとケイシーは死んだと伝え、日本の新幹線に乗せインターセクトの欠陥を直すよう命じる。サラ達もこっそり同じ新幹線に乗り込んでいた。
インターセクトでサラがクインを捕らえるが、クインは部下に命じてアレックスを拉致し、ケイシーを操ろうとする。サラは不具合のあるインターセクトを使いこなせず、クインを新幹線から放り出してしまう。
エリーとデヴォンはモーガンがインターセクトで記憶を失くした原因を探っていて、データをよみがえらせる回数に比例して記憶を失くしていくことがわかる。ケイシーに頼まれて、モーガンとデヴォンはアレックスの行方を追っていたが、敵に捕まってしまう。
前回、記憶を失くした件を突き止めようと、ジェフとレスターはモーガンとデヴォンの後を付けていた。
第12話 チャック VS サラ
あらすじ・感想
クインはチャックとチームメンバーは悪人だと伝え、彼らを皆殺しにしてインターセクト・サングラスを手に入れるよう命じる。サラはクインに疑惑を感じつつも、以前のサラとして振舞いチャックも喜んでいた。
しかし、サラの様子がおかしい事に気づいてエリーに相談し、インターセクト・サングラスを破壊したいと話しているのをサラはこっそり聞いていた。みんなをキャッスルに集め、サングラスがあるDARPAへの侵入進入方法などを話し合う。
サラはチャックのかばんからサングラスを盗み出す。DARPAへ侵入してサラは単独行動を取り、サングラスにインターセクトをアップロードする。モーガンを人質にして銃を向け、彼らをインターセクトルームに閉じ込めて爆弾をドアに設置して逃走する。
リモートでクインが爆発させるが、中にいたチャック達は無事だった。
第13話 チャック VS さよなら
あらすじ・感想
サラが去ってから2週間経つ。クインはインターセクトを正常に機能させる3つのキーのうち、1つを元フルクラムのエドガーから買おうとしている。サラは自分から全てを奪ったクインを阻止しようとするが、飛行機から突き落とされてしまう。
チャックはすっかり落ち込んでいて、エリーやデヴォン、モーガンが心配している。サラを取り戻して刺激を与えれば、記憶が戻る可能性があると励ます。そんな中、サラがチャックを訪ねてバイ・モアにやって来る。
キャッスルのシステムで、キーを持つ元リングのレニーを探してほしいとのこと。彼がベルリンにいることがわかり、サラとチャック、モーガンが現地へ。チャックはサラに色んな思い出を話すが、サラから任務に集中したいと言われてしまう。
やがて、クインはレニーと会って彼を殺してキーを手に入れる。